Seminar:
Biologie - zwischen Ordnung
und Chaos (SoSe2000)
Themenplan
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Grundbegriffe der Chaosforschung
Beispiel Drehpendel, Zustandsraum (Phasenraum), Trajektorien, Attraktoren,
Fehlerwachstum, Ljapunov-Exponent, Poincare-Schnitt, Mischungsverhalten,
Bäckertransformation
Literatur:
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H.G.Schuster[6] S.101 ff;
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Worg[5] Phasenraum: S.54-57, seltsamer Attraktor, Poincaré-Schnitt,
Bäcker-Transformation: 70-84, Ljapunov-Exponent: 116-124
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"Chaos - Bausteine der Ordnung", Peitgen, Jürgens, Saupe
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Wege ins Chaos
am Beispiel der Verhulst-Dynamik: Periodenverdopplungskaskade, Intermittenz,
Quasiperiodizität
Literatur:
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Heinrichs [4] S. 37-59
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"Chaos - Bausteine der Ordnung", Peitgen, Jürgens, Saupe
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Chaos in neuronalen Systemen
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"Synchronous period-doubling in flicker vision of salamander and man."
Crevier DW, Meister M; J Neurophysiol 1998 Apr;79(4):1869-78
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"Bifurcations in the decremental propagation of a spike train in the Hodgkin-Huxley
model of low excitability." Horikawa Y ;Biol Cybern 1998 Sep;79(3):251-61
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Chaos in biochemischen Systemen
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"Oszillierende chemische Reaktionen" in "Chaos und Fraktale" [1] S.72-81
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"Ordnung und Chaos in chemischen Uhren", Benno Hess/Mario Markus in Küppers
[2] S. 157-173
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"Oszillierende chemische und biochemische Systeme. Die Belusov-Zhabotinskii-Reaktion"
in "Grundkurs Biomatmematik" [7] S. 131-137
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"Oscillations and chaos in cellular metabolism and physiological systems"
P.E. Rapp "Chaos", Arun v. Holden [18]
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Die fraktale Dynamik der Herzfrequenz-Regulation (Prof. Michael
Meyer aus
Göttingen)
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Ein Grundprinzip von Strukturbildung: Das Turing-Modell
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Kapitel 2 "Musterbildung" (S. 19-38) in "Wie Schnecken sich in Schale werfen",
Hans Meinhardt [19]
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"Bildung geordneter Strukturen bei der Entwicklung höherer Organismen",
Hans Meinhardt in Küppers[2] S. 215-241
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Organisator-Regionen: Speman-Organisator und Henssenscher Knoten
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S. 217-220 in "Wie Schnecken sich in Schale werfen", Hans Meinhardt [19]
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weitere Literatur bei Dr. Schneider
- cAMP und ATP als universelles Turing-Paar?
"An hyphothesis: phsphorylation fields as the source of positional
information and cell differentiation - (cAMP, ATP) as the universal
morphogenetic turing couple", Y. Schiffmann; Prog. Biophys. molec. Biol.,
Vol.56. pp. 79-105, 1991
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Vegetationsmuster
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"Regular and Irregular Patterns in Semiarid Vegetation" Christopher A.
Klausmeier, SIENCE, 11.Juni 1999 Vol 284, S. 1826-1828
- "A model simulating the genesis of banded vegetation patterns in niger"
J.M.Thiery et al.; Journal of Ecology 1995, 83, 497-507
- "A model for the explanation of vegetation stripes (tiger bush)"
Lejeune, O. & Tlidi, M.; Journal of Vegetation Science 10:201-208, 1999
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Ausbreitungswellen hinterlassen räumliche Muster
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"Oscillating dispersal patterns of tepheritid fly populations" F. Jeltsch,
Wissel, Eber, Brandl; Ecological Modelling, 60(1992)63-75
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Tollwutausbreitung
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wenn mehr als 9 Seminartage möglich:
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Fraktale und fraktale Dimension
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"Fraktales Wachstum", Leonard M. Sander in "Chaos und Fraktale" [1] S.120-126
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"Chaos" G.Heinrichs[4] S.82ff: "Selbstähnlichkeit und Kapazitätsdimension"
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"Die fraktale Dimension - Ein Maß für die Struktur", Worg [5]
S. 125-147
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Peak/Frame [3] S.82ff: Unirdische irdische Dimensionen"
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"Fraktale - eine neue Sprache für komplexe Strukturen" in "Chaos und
Fraktale" [1] S.106-118
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"Bausteine des Chaos - Fraktale" [8]: Kapitel 4 "Fraktale Dimensionen:
Messen von Komplexität"
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"Chaos - Bausteine der Ordnung" [9]
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Herzdynamik
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"Evidence for chaotic behavior in driven ventricles", Savino et. al., Biophys
J 1989 Aug;56(2):273-80
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"Alternans and period-doubling bifurcations in atrioventricular nodal conduction",
Sun et. al., J Theor Biol 1995 Mar 7;173(1):79-91
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Dr. M. Rosenblum in Nature (3.6.99): "Multifractality in human heart beat"
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"Sekundenherztod: Hilfe von der Topologie?" v. Arthur T. Winfree in "Chaos
und Fraktale"[1] S.92-105
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"Schwarze Löcher in der Biologie" in "Grundkurs Biomathematik" [7]S.195-204
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"Der Urknall, das EKG und der Wunsch nach einem schnellen Ende" in "Faszination
Chaos"[17],S.101-111
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Evolutionsgenetik: das Sequenzraum-Konzept und Manfred Eigens Quasispezies-Modell
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"Das Konzept des Sequenzraumes", Manfred Eigen in "Stufen zum Leben" [13]
Kap. 12 S.203-213
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"Populationsdynamik auf Sequenzräumen", Andreas Dress in Küppers[2]
S. 103-125
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"Spingläser", Daniel Stein in "Chaos und Fraktale" [1] S. 146-152
an separatem Termin:
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Experiment: Drehpendel mit Unwucht
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"Wege ins Chaos - aharmonische Schwingungen "Worg [5] S.37-57
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Experiment: aharmonischer elektrischer Oszillator
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"Simulation des aharmonischen Oszillators" Heinrichs [4] S.25-31
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Experiment: Belussov-Zhabotinsky-Reaktion
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H.D. Försterling: "Rhuthenium-katalysierte BZ-Reaktion" S. 13-14
Literatur:
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Sektrum der Wissenschaft: Verständliche Forschung "Chaos
und Fraktale" (Lehrbuchsammlung)
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Bernd-Olaf Küppers (Hrsg.): "Ordnung aus dem Chaos -
Prinzipien der Selbstorganisation und Evolution des Lebens" (UB-Magazin)
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David Peak / Michael Frame: "Komplexität - das gezähmte
Chaos"(UB-Magazin)
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Georg Heinrichs: "Chaos" (Lehrbuchsammlung)
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Roman Worg: "Deterministisches Chaos - Wege in die nichtlineare
Dynamik" (Lehrbuchsammlung)
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Heinz Georg Schuster: "Deterministisches Chaos - eine Einführung"
(Lehrbuchsammlung)
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R. Schuster: "Grundkurs Biomathematik" (Lehrbuchsammlung)
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Heinz-Otto Peitgen, Hartmut Jürgens, Dietmar Saupe:
"Bausteine des Chaos - Fraktale"
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Heinz-Otto Peitgen, Hartmut Jürgens, Dietmar Saupe:
"Chaos - Bausteine der Ordnung"(UB-Magazin)
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Grégoire Nicolis, Ilya Prigogine: "Die Erforschung
des Komplexen"(UB-Magazin)
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Spektrum der Wissenschaft: Verständliche Forschung:
"Computer-Kurzweil" (Lehrbuchsammlung)
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Hermann Haken, Arne Wunderlin: "Die Selbststrukturierung
der Materie" (Lehrbuchsammlung)
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Manfred Eigen: "Stufen zum Leben - Die frühe Evolution
im Visier der Molekularbiologie"
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David Ruelle: "Zufall und Chaos"(UB-Magazin)
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Jack Cohen, Ian Stewart: "Chaos und Anti-Chaos"
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J. Agyris, G. Faust, M. Haase: "Die Erforschung des Chaos".
Braunschweig,Vieweg, 1994 (Physik-Bibliothek)
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Christian Nürnberger: "Faszination Chaos - Wie zufällig
Ordnung entsteht' (UB-Magazin)
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Arun v. Holden: "Chaos" (Bibliothek der AG Neurophysik)
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Hans Meinhardt: "Wie Schnecken sich in Schale werfen"